13 июня 2017 года АО «Фонд национального благосостояния «Самрук-Қазына» сообщило Казахстанской фондовой бирже о решении его единственного акционера о реорганизации АО «Национальная компания «КазМунайГаз» путем присоединения к нему АО «КазМунайГаз — переработка и маркетинг».
7 июня 2017 года было подписано Постановлению Правительства Республики Казахстан № 344 "О некоторых вопросах акционерного общества «Национальная компания «КазМунайГаз», в котором приведено следующее: «Реорганизовать акционерное общество «Национальная компания «КазМунайГаз» путем присоединения к нему акционерного общества «КазМунайГаз — переработка и маркетинг».
В Постановлении также указывается, что акционерному обществу «КазМунайГаз — переработка и маркетинг» разрешается произвести отчуждение 100 % пакета акций Trade house KazMunaiGaz N. V., 50 % пакета акций Valsera Holdings B.V., 49,7 % доли участия ТОО PetroKazakhstan Oil Products, 99,54 % доли участия ТОО «Атырауский нефтеперерабатывающий завод» в пользу акционерного общества «Национальная компания «КазМунайГаз».
На сегодня АО «НК «КазМунайГаз» владеет 100% акций АО «КазМунайГаз — переработка и маркетинг».
В 2002 году для организации и проведения транспортных и торговых операций с нефтью и продуктами ее переработки на территории Республики Казахстан и за рубежом была создана 100 процентная дочерняя организация акционерного общества Национальная компания «КазМунайГаз» — ТОО «Торговый дом «КазМунайГаз», которое вскоре было преобразовано в закрытое акционерное общество и впоследствии в акционерное общество.
В 2010 году акционерное общество «Торговый дом «КазМунайГаз» было переименовано в акционерное общество «КазМунайГаз — переработка и маркетинг». В активе компании — ТОО «Атырауский НПЗ» (99,53%), ТОО «ПетроКазахстан Ойл Продактс» (49,7%), ТОО «Павлодарский НХЗ» (100%), ТОО «КазМунайГаз Өнімдері» (100%),ТОО «КазМунайГаз - Аэро» (100%), ТОО СП «Caspi Bitum» (50%).
